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3,1重組DNA技術的基本工具課件(共49張PPT)

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  1. 二一教育資源

3,1重組DNA技術的基本工具課件(共49張PPT)

資源簡介

(共49張PPT)
§3-1 重組DNA技術的基本工具
基因工程
抗蟲棉
棉花細胞
普通棉花
(無抗蟲特征)
(含抗蟲基因)
棉花植株
(有抗蟲特征)
基因工程
抗蟲基因
提取
蘇云金芽孢桿菌(簡稱Bt)
(有抗蟲特征)


別 名 基因拼接技術
或DNA重組技術
操作環境 生物體外
操作對象 基 因
操作水平 DNA分子水平
基本過程 剪切→拼接→導入→表達
結 果 人類需要的基因產物
原 理 基因重組(廣義)
基因工程的概念考點解析:
優點:
定向改造生物體的性狀(目的性強)
基因重組的三種類型
①減數第一次分裂前期:同源染色體上的非等位基因重組
②減數第一次分裂后期:非同源染色體上的非等位基因重組
③基因工程操作導致的基因重組
①不同生物的DNA能夠進行拼接嗎?
②Bt基因在棉花細胞中能夠表達?
①基因是控制生物性狀的遺傳物質的結構和功能單位
②遺傳信息的傳遞都遵循中心法則
③生物界共用一套遺傳密碼
理論基礎
蘇云
金桿菌
Bt基因
普通棉
花DNA
抗蟲棉
提取
導入
表達
能,
①DNA的基本組成單位相同
②都遵循堿基互補配對原則
③DNA分子的空間結構都是規則的雙螺旋結構
番木瓜容易受番木瓜環斑病毒的侵襲。當番木瓜被這種病毒感染后,產量會大大下降。科學家通過精心設計,用“分子工具”培育出了轉基因番木瓜,它可以抵御番木瓜環斑病毒。
到社會中去
DNA雙螺旋的直徑只有2nm,對如此微小的分子進行操作,是一項非常精細的工作,更需要專門的“分子工具”。
那么,科學家究竟用到了哪些“分子工具”?
這些“分子工具”各具有什么特征呢?
轉基因番木瓜(左)與非轉基因番木瓜(右)
“分子手術刀”
準確切割DNA分子
“分子縫合針”
“分子運輸車”
將DNA片段連接起來
將體外重組好的DNA分子導入受體細胞
限制性內切核酸酶
DNA連接酶
基因進入受體細胞的載體
【易錯警示】工具酶≠工具
基因工程的基本工具
一、限制性內切核酸酶—“分子手術刀”
切割DNA分子的工具是限制性內切核酸酶,又稱 。
1.來源:
2.種類:
主要來自原核生物
限制酶
數千種
限制酶不是一種酶,而是一類酶
3.作用特點:
專一性
能識別雙鏈DNA分子的特定核苷酸序列,并使每一條鏈中特定部位的磷酸二酯鍵斷開。
限制酶
限制酶
切割的是什么?
兩個脫氧核苷酸之間的磷酸二酯鍵
氫鍵自動斷開
4.識別序列:
EcoR Ⅰ
5’…G-A-A-T-T-C…3’
3’…C-T-T-A-A-G…5’
Sma Ⅰ
5’…C-C-C-G-G-G…3’
3’…G-G-G-C-C-C…5’
BamH Ⅰ
5’…G-G-A-T-C-C…3’
3’…C-C-T-A-G-G…5’
Taq Ⅰ
5’……T-C-G-A……3’
3’……A-G-C-T……5’
限制酶所識別的序列的特點是:呈現堿基互補對稱,無論是6個堿基還是4個堿基,都可以找到一條中心軸線,中軸線兩側的雙鏈DNA上的堿基是反向對稱重復排列的,稱為回文序列。
在切割部位,一條鏈從5’往3’讀的堿基順序與另一條鏈5’往3’讀的順序完全一致。
一、限制性內切核酸酶—“分子手術刀”
黏性末端    
黏性末端
EcoRI限制酶的切割
只能識別GAATTC序列,并在G和A之間切開。
一.重組DNA技術的基本工具----限制酶
平末端   平末端
SmaI限制酶的切割
只能識別CCCGGG序列,并在C和G之間切開
一.重組DNA技術的基本工具----限制酶
一、限制性內切核酸酶—“分子手術刀”
5.切割結果:
產生黏性末端或平末端
推斷限制酶切一次:
斷開 個磷酸二酯鍵,產生 個游離的磷酸基團,產生 個黏性末端,
消耗 分子水。

2
2

6. 種類與命名:
現在已經從約300種微生物中分離出了約
4000種限制性內切酶(限制酶)。
EcoRⅠ
SmaⅠ
粘質沙雷氏桿菌
(Serratia marcesens)
大腸桿菌
(Escherichia coli R)
練習:流感嗜血桿菌的d菌株
( Haemophilus influenzae d )中先后分離到3種限制酶,則分別命名為:
HindⅠ、HindⅡ和HindⅢ
寫出下列限制酶切割形成的黏性末端
BamH Ⅰ:
-G
-CCTAG
*思考:你從中發現什么現象了?
不同的限制酶可能切割形成相同的黏性末端。
5'
3'
5'
3'
5'
3'
5'
3'
3'
5'
5'
3'
5'
5'
3'
3'
GATCC-
G-
Bgl Ⅱ:
EcoR Ⅰ:
-G
-CTTAA
AATTC-
G-
形成的黏性末端(從5’往3’讀)
Hind Ⅲ:
-A
-TTCGA
AGCTT-
A-
-A
-TCTAG
GATCT-
A-



1.要想獲得某個特定性狀的基因必須要用限制酶切幾個切口?
可產生幾個黏性末端?
要切兩個切口,產生四個黏性末端。
2.如果把兩種來源不同的DNA用同一種限制酶來切割,會怎樣呢?
會產生相同的黏性末端
3.限制酶能切開RNA分子的磷酸二酯鍵嗎?
不能。限制酶只能識別并切開雙鏈DNA分子。
思考
同種限制酶切割產生的黏性末端相同;不同限制酶切割,產生的黏性末端可能相同,也可能不同。
技巧:圖片倒轉180°,完全相同則為同一種限制酶切割
下列黏性末端最可能由同種限制酶切割而成的是( )
① ②
③      ④
                  
A.①② B.①③ C.①④ D.②③
B
一.重組DNA技術的基本工具----限制酶
①判斷兩個末端是否為同一種限制酶切割產生的方法:將其中一個末端旋轉180度,若與另一個完全相同,則說明兩個末端是用同一種限制酶切割
②兩個末端若是由同一種限制酶切割產生的,則兩個片段連接后還具有該種限制酶的識別序列和切割位點
-G
-CCTAG
GATCT-
A-
GATCC-
G-
請判斷:以下黏性末端是由 種限制酶作用產生的。



3
若為同種限制酶,則切割形成的黏性末端及切割位點應相同。
【P71旁欄思考題】限制酶存在于原核生物中的作用是什么?
原核生物易受自然界外源DNA的入侵,但生物在長期的進化過程中形成了一套完善的防御機制,以防止外來病原物的侵害。限制酶就是細菌的一種防御性工具,當外源DNA侵入時,會利用限制酶將外源DNA切割掉,以保證自身的安全。所以,限制酶在原核生物中主要起到切割外源DNA、起防御作用。
原核細胞DNA中不存在限制酶的識別序列或能被識別的序列被修飾了。
【P74拓展應用1】為什么限制酶不切割細菌本身的DNA分子?
二、DNA連接酶—“分子縫合針”
1.作用:
2.種類:
將雙鏈DNA片段“縫合”起來,恢復被限制酶切開的兩個核苷酸之間的磷酸二酯鍵。
類型 E.coli DNA連接酶 T4 DNA連接酶
來源
功能 只縫合____________ 縫合__________和_______________
結果 恢復被限制酶切開的兩個核苷酸之間的_________________ 大腸桿菌
T4噬菌體
黏性末端
黏性末端
平末端(效率低)
磷酸二酯鍵
注意:不是連接氫鍵
(氫鍵的形成不需要酶的催化)
E.coli DNA連接酶、T4 DNA連接酶
兩DNA片段要具有相同的黏性末端才能拼起來
DNA聚合酶的作用
DNA連接酶與DNA聚合酶是一回事嗎?
A A T T G
A
A
A
T
T
不是,連接的對象不同
A
DNA聚合酶
A
DNA聚合酶
DNA聚合酶
DNA聚合酶
DNA連接酶 DNA聚合酶
相同點 作用實質 化學本質 不 同 點 模板
作用對象
作用結果
用途
催化兩個脫氧核苷酸之間形成磷酸二酯鍵
都是蛋白質
不需要
需要DNA的一條鏈作模板
形成完整的重組DNA分子
形成DNA的一條鏈
基因工程
DNA復制
只能將單個核苷酸連接到已有的DNA片段上,形成磷酸二酯鍵
在兩個DNA片段之間形成磷酸二酯鍵
一.重組DNA技術的基本工具--DNA連接酶
旁欄思考(P72):DNA連接酶與DNA聚合酶是一回事嗎?為什么?
與DNA相關的五種酶的比較
名稱 作用部位 作用對象 作用結果
限制酶
DNA連接酶
DNA聚合酶
DNA(水解)酶
解旋酶
磷酸二酯鍵
磷酸二酯鍵
磷酸二酯鍵
磷酸二酯鍵
堿基對之間
的氫鍵
DNA
DNA片段
單個的脫氧
核苷酸
DNA
DNA
將DNA切成兩個片段,形成
黏性末端或平末端
將兩個DNA片段連接為一個DNA分子
將單個脫氧核苷酸依次連接到單鏈末端,形成新的DNA分子
將DNA片段水解為單個脫氧核苷酸
將雙鏈DNA分子局部解旋為單鏈,形成兩條長鏈
思考3:Bt基因是否可以直接導入到棉花細胞(受體細胞)?為什么?
否,目的基因直接導入受體細胞可能會被細胞中的酶降解或不能復制、表達。
思考4:有沒有什么DNA分子可以進入宿主細胞并復制表達?
三、基因進入受體細胞的載體—“分子運輸車”
1.作用:
2.種類:
質粒、噬菌體和動植物病毒等。
將目的基因轉入受體細胞,在受體細胞內對目的基因進行大量復制。
種類 用途 不同點
質粒、噬菌體
植物病毒 動物病毒 將外源基因導入大腸桿菌
等受體細胞
將外源基因導入植物細胞
將外源基因導入動物細胞
來源不同,在大小、結構、復制方式以及可以插入外源DNA片段的大小也有很大差別
3.最常用的載體——質粒
一種裸露的、結構簡單、獨立于真核細胞細胞核或原核細胞擬核DNA之外,并具有自我復制能力的環狀雙鏈DNA分子。
標記基因
其基因屬于細胞質基因。
三、基因進入受體細胞的載體—“分子運輸車”
標記基因:①抗生素抗性基因②熒光蛋白基因
三、基因進入受體細胞的載體—“分子運輸車”
4.運載體需具備的條件:
①在受體細胞中穩定存在并能自我復制
或整合到受體DNA上,隨受體DNA同
步復制;
②有一個至多個限制酶切割位點,
便于插入(攜帶)目的基因;
③具有標記基因,便于篩選含有重組
DNA分子的細胞;
④對受體細胞無害、易分離。
真正被用作載體的質粒,都是在天然質粒的基礎上進行過人工改造的。
霍亂弧菌的質粒有多個限制酶切位點,你會用它做載體嗎?
如何確定目的基因是否進入受體細胞了?
載體上的標記基因一般是某種抗生素的抗性基因,而受體細胞沒有抵抗該抗生素的能力。將含有某抗生素抗性基因的載體導入受體細胞,抗性基因在受體細胞內表達,受體細胞對該抗生素產生抗性。在含有該抗生素的培養基上,能夠生存的是被導入了載體的受體細胞。
標記基因的篩選原理
思考·討論:重組DNA分子
請你根據圖3-3中的相關信息找到兩條片段上EcoRI 的識別序列和切割位點。 然后,用剪刀進行“切割”。待切割位點全部切開后,將從下面那條DNA鏈上切下的片段重組到上面那條DNA鏈的切口處,并用透明膠條將切口粘連起來。
…TATCGTACGATAGGTACTTAA
…ATAGCATGCTATCCATG
AATTCGGCATAC…
GCCGTATG…
…TCCTAG
…AGGATCTTAA
GAGCCATACTTAA
AATTCTCGGTATG
AATTCCATAC…
GGTATG…
GAGCCATACTTAA
AATTCTCGGTATG
1、剪刀和透明膠條分別代表哪種“分子工具”?
剪刀代表限制酶;透明膠條代表DNA連接酶。
如果制作的黏性末端的堿基不能互補配對,可能是剪切位點或連接位點選得不對,也可能是其他原因。
不能,因為基因的長度一般在100個堿基對以上。
2、你制作的黏性末端的堿基能不能互補配對?如果不能,可能是什么原因造成的?
3、你插入的DNA片段能稱得上一個基因嗎?
…TATCGTACGATAGGTACTTAA
…ATAGCATGCTATCCATG
AATTCGGCATAC…
GCCGTATG…
GAGCCATACTTAA
AATTCTCGGTATG
4、從以上操作可推知,在切割含“目的片段”的DNA分子時,需用限制酶切割____次此DNA分子,產生____個黏性末端。
2
4
鏈狀DNA分子
1個酶切割位點,若用限制酶完全切割完后形成____個DNA片段
2個酶切割位點,若用限制酶完全切割完后形成____個DNA片段
環狀DNA分子
1個酶切割位點,若用限制酶完全切割完后形成____個DNA片段
2個酶切割位點,若用限制酶完全切割完后形成____個DNA片段
2
3
2
1
用相同的限制酶切割目的基因和運載體。
產生相同末端,便于連接。
5.目的基因是要與運載體結合的,那如何
處理質粒?
★重組質粒的形成:
用相同的限制酶處理目的基因和運載體,獲得相同的末端,然后用DNA連接酶對其進行連接。
思考討論
思考:
1.如果用一種限制酶分別切割目的基因和質粒,再用DNA連接酶處理后會出現幾種產物?(只考慮兩兩結合)
①目的基因-目的基因連接
③目的基因-質粒連接
②質粒-質粒連接
④目的基因自身環化
⑤質粒自身環化
結論:為避免目的基因和質粒的自身環化及目的基因與質粒的反向連接,可使用兩種不同的限制酶切割目的基因和質粒
雙酶切法
技能提升
(1)獲取目的基因和切割載體時, 通常使用同種限制酶,目的是為了
。但是使用該法缺點是容易發生
以及 ,為了避免上述情況發生,可采取的措施是

產生相同的黏性末端,便于連接
目的基因與質粒反向連接
目的基因、質粒的自身環化
分別使用兩種限制酶(雙酶切法)去切割目的基因和載體
(2)獲取一個目的基因需限制酶切割 次,共產生 個游離的磷酸基團。

4
思考討論
(3)選擇限制酶切割位點的基本原則:
①切割目的基因時: 。
②切割質粒時: 。
能切下目的基因且不破壞目的基因
至少保留一個完整的標記基因,便于篩選
思考討論
限制酶
DNA連接酶
載體
①對受體細胞無害;
②有一個至多個限制酶切割位點;
③有特殊的標記基因;
④能自我復制或能整合到宿主DNA上。
質粒、 λ噬菌體衍生物 、動植物病毒
基因工程的基本工具
作為載體的條件
種類:
磷酸二酯鍵
來源:
主要來源于原核生物
特點:
作用部位:
具有專一性
結果:
形成黏性末端或平末端
連接部位:磷酸二酯鍵
種類: E.coliDNA連接酶、T4 DNA連接酶
作用:把兩條雙鏈DNA片段拼接起來
課堂小結
DNA的粗提取與鑒定
0
0.14
NaCI濃度(mol/L)
1.實驗原理
利用DNA與RNA、蛋白質和脂質等在物理和化學性質方面的差異,提取DNA,去除其他成分。
DNA不溶于酒精,
但某些蛋白質溶于酒精
DNA能溶于物質的量濃度為2 mol/L的NaCl溶液
在一定溫度下,
DNA被二苯胺試劑染成藍色
初步分離DNA和蛋白質
溶解DNA
鑒定DNA
DNA的粗提取與鑒定
2.材料用具
(1)材料:
富含DNA的材料(如新鮮洋蔥、香蕉、菠菜和豬肝等)、研磨液、體積分數為95%的酒精、2 mol/L的NaCl溶液、二苯胺試劑和蒸餾水等。
(2)用具:
燒杯、量筒、玻璃棒、研缽、紗布、漏斗、試管、試管架、試管夾、酒精燈、石棉網、三腳架、火柴、刀片和天平等。
不能選擇哺乳動物成熟的紅細胞,因為哺乳動物成熟的紅細胞中沒有細胞核和線粒體,幾乎不含DNA。
研磨液成分 作用
SDS 使蛋白質變性
EDTA 抑制DNA酶
Tris-HCl緩沖液 穩定DNA
析出DNA
溶解DNA
鑒定DNA
3.方法步驟
(1)通過研磨釋放 DNA
稱取約30g 洋蔥,切碎,然后放入研缽中,倒入10 mL 研磨液,充分研磨(可加入少量石英砂助研)。
①研磨的目的:
②研磨時間不宜太長:
③有條件的可以在材料處理的過程中加入纖維素酶、果膠酶:
④研磨不宜太用力
DNA的粗提取與鑒定
破碎細胞,使核物質容易溶解在研磨液中
防止研磨時產生的熱量影響DNA的提取量
研磨效果好(有利于充分研磨)
3.方法步驟
(2)過濾獲取含DNA的上清液
DNA的粗提取與鑒定
可能含有核蛋白、多糖等雜質
在漏斗中墊上紗布,將洋蔥研磨液過濾到燒杯中,在4℃冰箱中放置幾分鐘后,再取上清液。也可以直接將研磨液倒入塑料離心管中,在1500 r / min 的轉速下離心5 min ,再取上清液放入燒杯中。
過濾能用濾紙代替嗎?
低溫放置幾分鐘的作用:
①可抑制核酸水解酶的活性,進而抑制DNA降解;
②抑制DNA分子運動,使DNA易形成沉淀析出;
③低溫有利于增加DNA的柔韌性,減少其斷裂。
不可以,因為DNA會被吸附到濾紙上而大量損失。
在上清液中加入體積相等的、預冷的酒精溶液(體積分數為95%),靜置2~3 min,溶液中出現的白色絲狀物就是粗提取的DNA。用玻璃棒沿一個方向攪拌,卷起絲狀物,并用濾紙吸去上面的水分;或者將溶液倒入塑料離心管中,在10000r/min的轉速下離心5min,棄上清液,將管底的沉淀物(粗提取的DNA)晾干。
減少DNA斷裂,以便獲得較完整的DNA分子。
①抑制核酸水解酶活性,防止DNA降解;
②低溫有利于增加DNA分子柔韌性,減少斷裂。
③使蛋白質溶解在酒精中,DNA不溶于酒精而析出。
(3)冷卻酒精析出DNA
3.方法步驟
DNA的粗提取與鑒定
(4)DNA的鑒定
取兩支20mL的試管,各加入2mol/L的NaCl溶液5mL。將絲狀物或沉淀物溶于其中一支試管的NaCI溶液中。向兩支試管中各加入4mL的二苯胺試劑。混合均勻后,將試管置于沸水中加熱5min。待試管冷卻后,比較兩支試管中溶液顏色的變化。
加入2mol/L氯化鈉溶液
不加入絲狀物
加入4mL二苯胺試劑
加入2mol/L氯化鈉溶液
加入絲狀物
加入4mL二苯胺試劑
實驗組
水浴加熱
對照組
溶液藍色的深淺與溶液中DNA的含量的多少有關
3.方法步驟
DNA的粗提取與鑒定
4.結果分析
DNA的粗提取與鑒定
鑒定結果不明顯的可能原因:
①材料中的核物質沒有充分釋放出來,如研磨不充分或蒸餾水的量不夠。②加入酒精后搖動或攪拌時過猛,DNA被破壞。
③二苯胺最好現用現配,否則二苯胺變色,影響鑒定效果。
1.怎么確認實驗提取出來的是DNA所含雜質較少?若鑒定結果呈現藍色比
較淺,說明什么問題?
觀察提取的DNA的顏色,如果不是白色絲狀物,說明DNA中的雜質較多。
4.進一步探究
DNA的粗提取與鑒定
為了提純DNA,某同學提出以下實驗方案,請分析原因:
操作2:上述得到的DNA提取液,緩緩加入蒸餾水,調節NaCl溶液的濃度為0.14mol/L,玻璃棒攪拌,析出DNA。
操作1:得到的DNA粗提取物(絲狀物或沉淀)加入2mol/L的NaCl溶液溶解,過濾,取濾液(DNA提取液)。
用高鹽濃度的溶液溶解DNA,能除去在高鹽溶液中不能溶解的雜質;
用低鹽溶液使DNA析出,能除去溶解在低鹽溶液中的雜質。
因此,通過反復溶解與析出DNA,就能夠除去與DNA溶解度不同的多種雜質。
5.進一步探究
0
0.14
NaCI濃度(mol/L)
DNA的粗提取與鑒定
5.進一步探究
方法二:可以先添加質量分數為25%的SDS溶液,使蛋白質變性后與DNA分開;隨后,加入氯仿—異丙醇混合液(體積比為24:1),通過離心將蛋白質及其他雜質除去,取上清液;可重復上述操作幾次,直至上清液變成透明的黏稠液體。
方法三:由于苯酚可以迅速使蛋白質變性,抑制核酸酶的活性,因此還可以先用苯酚處理,然后離心分層,這時DNA溶于上層水相,蛋白質變性后存在于酚層中,用吸管、微量移液器等實驗用具就可以將兩者分開。
練習與應用
一、概念檢測
1. DNA連接酶是重組DNA技術常用的一種工具酶。下列相關敘述正確的是( )
A.能連接DNA分子雙鏈堿基對之間的氫鍵
B.能將單個脫氧核苷酸加到DNA片段的末端,形成磷酸二酯鍵
C.能連接用同種限制酶切開的兩條DNA片段,重新形成磷酸二酯鍵
D.只能連接雙鏈DNA片段互補的黏性末端,不能連接雙鏈DNA片段的平末端
2.在重組DNA技術中,將外源基因送入受體細胞的載體可以是( )
A.大腸桿菌的質粒 B.切割DNA分子的酶
C.DNA片段的黏性末端 D.用來識別特定基因的DNA探針
C
A
【擴展應用】有2個不同來源的DNA片段A和B,A片段用限制酶切speⅠ進行切割,B片段分別用限制酶HindⅢ, XbaⅠ、EcoRⅤ和XhoⅠ進行切割。各限制酶的識別序列和切割位點如下。
(1)哪種限制酶切割B片段產生的DNA片段能與限制酶speⅠ切割A片段產生的DNA片段相連接?為什么?
XbaⅠ。
因為XbaⅠ與SpeⅠ切割產生了相同的黏性末端。
(2)不同的限制酶切割可能產生相同的黏性末端,這在基因工程操作中有什么意義?
識別DNA分子中不同核苷酸序列,但能切割產生相同黏性末端的限制酶被稱為同尾酶。同尾酶使構建載體時,切割位點的選擇范圍擴大。
例如,我們選擇了用某種限制酶切割載體,如果目的基因的核苷酸序列中恰好含有該限制酶的識別序列,那么用該限制酶切割含有目的基因的DNA片段時,目的基因就很可能被切斷;這時可以考慮用合適的同尾酶(目的基因的核苷酸序列中不能有它的識別序列)來獲取目的基因。
練習與應用

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